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文章鏈接:http://www.hfuoe.tw/uploads/tmp/genedenovo-resume-1438571734.7158723.pdf

一、文章總體架構
這是典型的:(現象  + 分析)邏輯型的文章。 這類文章邏輯相對簡單清晰。
1)先有某種處理導致某些宏觀現象;
2)再使用某類技術(例如轉錄組測序、16s meta測序)觀測微觀指標,對宏觀現象進行解釋。

這篇文章的整體模式如下:
1、宏觀現象: 
胖瘦組的小鼠在相同的飼喂策略下,體重發生不同的變化模式;
2、微觀解釋:
使用16s meta 測序分析胃腸道微生物群落變化,與宏觀體重發生變化進行關聯,并對其進行部分解釋。

二、實驗設計
建立動物模型:“高油脂攝入組”組,培養胖子小鼠;“低油脂攝入”組,培養瘦子小鼠;挑選5只胖子構成胖組,5只瘦子構成瘦組,然后同時飼喂高低聚果糖飼料 8 周,然后分析的體重變化。
簡單理解:分兩組小鼠,服用保健食品2個月,然后研究保健品的作用。

三、文章結果
這篇文章結果部分邏輯比較簡要:
1. 宏觀現象
    瘦組小鼠(FL)和胖組小鼠(FO),都使用高低聚糖飼料飼喂,并在11、15、19周齡檢測體重。
   發現有兩點:
   1.1 兩組體重都在增長;
   1.2 瘦組小鼠增長更快;

2. 微觀 16s meta 多樣性分析
    主要在胃腸道環境微生物多樣性方面,主要從三點闡述其與宏觀現象間的關鍵:
     2.1 不同組次腸道微生物多樣性的區別;
     2.2 不同組次的聚類分組特點;
     2.3 具體到個別微生物類群上,不同組次間的區別; 

2.1不同組次腸道微生物多樣性的區別;
保健品可以養腸胃,所以兩組小組的腸道生物多樣性一直在提高。
從香農指數來看,瘦組小鼠(FL),在第一個時期多樣性極低,而在第二個時期顯著提高;胖組小鼠(FO),一開始的多樣性就較高,但在第三個時期又有顯著升高。

2.2不同組次腸道微生物多樣性的區別;
從PCA分析的結果來看,在攝入早期胖組和瘦組的小鼠差別明顯。而到了中后期,就幾乎沒有差別了(因為養腸胃都養的不錯)。

2.3具體到個別微生物類群上,不同組次間的存在區別。
例如,瘦組小鼠在早期有更低Bacteroidetes 豐度,而這似乎與它們的能量吸收效率有關。


小結
1、這篇文章結構簡單,在典型的現象 + 分析解釋的文章,這類思路發三份左右的期刊還是可以的。(Food &Function的IF ≈ 2.8)。
2、瘦子小鼠吃了健康食品為什么還增重更大。我認為其實原因很簡單,光吃不運動,再好的減肥茶也沒用。而胖子基礎已經很好,要再提高成績自然就難了,瘦子當然有更大的提高空間。

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