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RNA芯片服務

 RNA表達譜芯片服務

芯片名稱:Affymetrix GeneChip Human Genome U133 Plus 2.0 Array 
詳細介紹: 此款芯片包含了47,000個轉錄本,代表了38,500個明晰的人類基因。數據庫來源于GeneBank、dbEST、RefSeq、The sequence clusters在 UniGene database(Build 159 January 25 2003)創建,并通過Washington University EST trace repository和California大學、Santa Cruz Golden-Path人類基因組數據庫(April 2001 release)分析比對。此外,有9,921新probe sets代表6500個新基因,這些基因序列來源于GenBank, dbEST, and RefSeq,Sequence clusters在 UniGene database (Build 159, January 25, 2003)創建,并通過Washington大學EST trace repository 和NCBI human genome assembly(Build 31) 分析比對。

芯片推薦:GeneChip Human Transcriptome and Splice Junction Array 
詳細介紹:Affymetrix 新近推出的人類轉錄組和剪接體分析芯片(Human Transcriptome and Splice Junction Array),又稱GG-H芯片(Glue Grant Human Transcriptome Array,GG-H),是Affymetrix聯合Stanford大學和NIH的Glue Grant項目,共同研發的一種基于全新設計理念的芯片。這種芯片針對人類轉錄組全方位檢測的需要,分別對外顯子和外顯子連接區設計探針,可同時用于基因表達、替代性剪接和編碼區SNPs檢測;另外,該芯片還收錄了大量非編碼RNA片段,可用于非編碼RNA轉錄的檢測。

芯片推薦:GeneChip Human Exon 1.0ST Array  
詳細介紹:Affymetrix全轉錄本表達譜芯片產品,約有4個探針來針對每個外顯子,約有40個探針來針對每個基因,覆蓋經驗性及預測的外顯子序列。

芯片推薦:GeneChip Human Gene 1.0ST Array  
詳細介紹:該表達譜芯片覆蓋人全轉錄本;每個基因用大約25個探針來檢測,檢測28,869個功能明確基因的表達情況。

芯片推薦:Affymetrix Human Genome U219 Array Plate
芯片介紹:該款芯片可以同時針對96個樣品機型高通量的表達譜研究。可對36,000個以上的轉錄本和變異體進行精確的表達譜檢測;每個轉錄本的表達情況都是通過多重獨立反應來完成檢測工作的,從而獲得具有高精確性以及重復性的基因表達數據。數據來源于UniGene database219(2009年3月30日公布)、RefSeq version36(2009年7月13日公布)以及GeneBank中的全長人類mRNA(2009年5月12日)。
適用儀器:Gene Titan自動化芯片工作站

芯片推薦:Affymetrix GeneChip HT HG-U133+ PM Array Plate
芯片介紹:該款芯片使用Affymetrix GeneTitan系統進行檢測,可同時自動處理24或96個樣品,芯片信息與Affymetrix 人U133 Plus 2.0芯片相同。
適用儀器:Gene Titan自動化芯片工作站

芯片推薦:Affymetrix GeneChip Human Gene 1.1ST Plate
芯片介紹:該款芯片使用Affymetrix GeneTitan系統進行檢測,可同時自動處理24或96個樣品,芯片信息與Affymetrix GeneChip Human Gene 1.0ST Array相同。
適用儀器:Gene Titan自動化芯片工作站
 

 miRNA芯片服務
  Affymetrix miRNA芯片在一張芯片上覆蓋了多個物種,除了人、大小鼠外,還包括擬南芥、水稻、玉米等重要植物模式生物。
芯片名稱:Affymetrix GeneChip miRNA 3.0
技術特點
※ 探針設計覆蓋全面:全面覆蓋miRNA v17數據庫,檢測153個物種的miRNA,同時可以檢測snoRNA和scaRNA
※ 專一性設計:唯一一款能在一個試驗中對miRNA前體和成熟miRNA進行有效區分的芯片
※ 超高的靈敏度:在1amol中能檢測到94%的miRNA
※ 高度的可重復性:重復性高達0.95
※ 流程簡便:45分鐘完成整個實驗操作,無需預擴增或純化步驟
※ 起始樣本量少:僅需130ng的總RNA即可得到滿意的結果


產品介紹( 備注:Affymetrix miRNA芯片產品會根據Sanger miRBase數據庫不定期更新,購買時請注意芯片版本。)

 lncRNA芯片服務

芯片名稱:Affymetrix GeneChip Human  Transcriptome Array 2.0
Affymetrix最新開發的GeneChip? Human TranscriptomeArray 2.0芯片經過設計,可消除這些技術和分析限制。這一高分辨率芯片包含了超過六百萬條不同探針,覆蓋編碼和非編碼轉錄本。該芯片上70%的探針覆蓋編碼轉錄本的外顯子,其余30%的探針覆蓋外顯子之間的剪接位點和非編碼轉錄本。此芯片無以倫比的覆蓋度帶來了迄今為止最為深入的編碼和非編碼轉錄本研究。為了確保轉錄組的均一覆蓋,GeneChip Human TranscriptomeArray 2.0芯片為每個外顯子設計約10條探針,每個外顯子之間的剪接點有4條探針。這一覆蓋確保您每個實驗都能獲得完整、準確和可重復的數據。
GeneChip Human Transcriptome Array 2.0芯片的優點:
1、覆蓋>285,000個全長轉錄本
※ >245,000個非編碼轉錄本
※>40,000個編碼轉錄本
※ >339,000個探針組,覆蓋外顯子之間剪接位點
2、多個來源的數據經過編輯和組織
※ 減少冗余的探針組
※ 制定目前最全面的基因模式
3、外顯子水平分析的集成方案
※ 實驗室流程與生物信息學分析無縫整合成一個解決方案
4、檢測選擇性剪接事件/轉錄本異構體
※ 探針旨在最大限度提高外顯子覆蓋度,讓您能檢測所有轉錄本異構體
5、對您的結果充滿信心
※ 可重復:批內相關系數≥0.99
※ 所有檢測過的組織觀察到的變異系數(CV)<6.5%
6、臨床和非臨床樣本都能獲得有意義的結果
※ 包括FFPE樣本(福爾馬林固定石蠟包埋)和新鮮凍存樣本
芯片參數:

 

 

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